個性豊かなキャラクターたちが、次々と巻き起こる難事件に立ち向かう人気ミステリーアニメの第6巻。抜群の推理力を誇る金田一耕助の孫・一と幼なじみ・美雪が、警察と対立しながらも共に事件解決を目指す。「魔術列車殺人事件」全4話を収録する。